全能神邪教与法轮功等其他邪教一样邪恶庸杂，总结其控制信徒的歪理邪说，大体有以下九种：
一、耶稣结束说
全能神邪教为了抬高自己，抛出了“耶稣结束说”，以便将信徒控制在自己股掌之中。他在《败坏的人类更需要道成“肉身”的神的拯救》中说：“道成肉身的神结束了‘只有耶和华的背影向人类显现’的时代，也结束了人类信仰渺茫神的时代。”全能神信徒称宗教修来世进天国所成的神是“渺茫神”，而他们所信的神才是“实际的神”，所以他们称“渺茫神”时代已经结束。
为了进一步让信徒远离基督教，又在《圣经的说法（四）》中说：“过去的事拿到今天都属于历史，再真、再实也是历史，历史不能针对现实……所以说你只明白圣经，不明白神现在要作的工作”。既然忘了基督教，那么更高的神是什么呢？于是，他又编造了“新时代”的邪说。“既然有了更高的道，何必研究那低的过时的道呢？既然有了更新的说话、更新的工作，何必还活在老旧的历史记载里呢？新的说话能供应你……旧的记载不能使你得饱足，满足不了你的现时的需求，证明这是历史，不是现时的工作。”（《圣经的说法（一）》）并进一步说：“新时代的诫命有它实际意义的一方面，是恩典时代与国度时代的交接点，新时代的诫命结束了一切旧时代的作法规条，结束了耶稣时代以及在这以前的一切作法，把人都带到了更实际的神的面前，让人都开始接受神的亲自成全，是人进入被成全之路的开端。”（《守诫命与实行真理》）既然进入了全能神的新时代，那么信徒们就应在新时代按教主的指示干一切事情，为他们心甘情愿地被教主精神控制做好了铺垫，为推出“道成肉身”的“实际神”埋下了伏笔。
二、道成肉身说
全能神邪教为了让信徒由信“神”改为信“人”、信教主，抛出了“道成肉身”说，把教主神话为“实际的神”。首先，他在《神所在“肉身”的实质》中称：“所谓道成肉身，就是神在肉身显现，神以肉身的形像来作工在受造的人中间……含义就是在肉身中作工、在肉身中生活的神，神的实质成了肉身，成了人。”一语道破天机，教主就是实实在在的神。
为了进一步神话自己，他把自己称为“基督”，在《基督的实质是顺服天父的旨意》中说：“道成肉身的神称为基督，基督就是神的灵所穿的肉身，这个肉身不同于任何一个属肉体的人。所谓的不同就是因为基督不属血气而是灵的化身，他有正常的人性与完全的神性。”很明显，全能神使用了偷梁换柱的伎俩，这里的“基督”不是常义的“基督”，而是“道成肉身的神”，是全能神教主自己。
为了骗取信徒的信任，他进一步解释自己是“有正常的人性与完全的神性”的完美结合体，并说“正常人性是为了维护在肉身中的一切正常活动的，神性是来作神自己的工作的。”他还为自己描述了一个美好的国度,“在国度时代，道成肉身的神说出话来征服所有信他的人，这就是‘话在肉身显现’了……就是来完成‘话在肉身显现’的实际意义。这是整个经营计划当中最末了的一项，所以神非得来在地上，把他的话语都显明在肉身中。”（《话语成就一切》）这样，一个完整的“肉身活神”就造成了。
三、三步作工说
全能神邪教所说的“作工”是指信徒为全能神效力所做的所有事情。全能神自称来到人间是为了“结束六千年的经营计划”，他把这一计划的完成过程归结为“三步作工”，第一步是指耶和华在“律法时代”为开创人类做的事情，第二步是指耶稣在“恩典时代”为救赎人类所做的事情，第三步是指全能神目前在“国度时代”以审判刑罚人类所做的事情。他在《救赎时代的工作内幕》中说：“在我的整个经营计划当中……一共分三个步骤，即三个时代：起初的律法时代、恩典时代（即救赎时代）、末了的国度时代。”这一邪说不仅给全能神邪教披上了宗教的外衣，使他们可以打着宗教信仰的幌子招摇过市，而且也给其秘密结社提供了理论根据。
为了让邪说变成真理，他在《作工异象(三)》中又强调说：“从耶和华到耶稣，从耶稣到这步所作的，三步工作贯穿下来是一部完整的经营，都是一位灵作的工作……他是初也是终，他是首先的也是末后的，他是开展时代的也是结束时代的……凡是将三步工作分割开来的都是抵挡神的。”“三步作工”利用了基督教的“律法时代”和“恩典时代”，别有用心地把这两个时代说成是神的两步作工，把他们现在的反社会、反人类的活动说成是神的第三步作工，并称第三步作工是最后一步，是审判、刑罚、征服人类的，不顺服这次作工的，都将被毁灭。这样，全能神邪教便成了基督教的“延续”和“进深”，而教主便成了结束“恩典时代”开创“国度时代”的全能神，他们便可以堂而皇之地把黑手伸向不明真相的人们。
四、神权至上说
邪教教主都有极强的权利欲望，但在现实中他们往往并不得志，所以，利用神权控制人便成了他们的惯用伎俩。全能神在《扩展福音的工作也是拯救人的工作》中拼命地叫嚣：“我要让所有的人都知道，我不仅是以色列人的神，我也是外邦各族之人的神，哪怕是我咒诅的邦族。”全能神邪教教主把自己打扮成神，有其不可告人的目的。“要让所有的受造之物、让各宗各派的各界人士都归在一位神的权下，不管你是哪个教派的最终都得归服在神的权下。”（《认识三步作工是认识神的途径》），这段话就是最好的表白。
为了树立绝对权威，让别人都俯伏在自己的脚下，为其效力，任其摆布，他对信徒百般利诱，在《基督起初的发表与见证·第二十八篇说话》中这样说：“你当知道现在是末世，魔鬼撒但如同吼叫的狮子，遍地游行，寻找可吞吃的人。各样的瘟疫正在发作，各种邪灵很多，只有我是真神，只有我是你的避难所。你现在只有藏在我的隐秘处，只有在我里面，灾害才不致临到你，祸患也不得挨近你的帐棚。”由此可见，全能神教主把自己打扮成“神”，是为了拥有“神”的本事，以消灾解难收买人，以天灾人祸吓唬人。如在《神主宰着全人类的命运》中他就这样说：“一个人抵挡神的作工，神会将这个人打入地狱；一个国家抵挡神的作工，神会将这个国家毁灭；一个民族起来反对神的作工，神会让这个民族在地球上消失，不复存在。”在这样的淫威之下，谁还敢不俯首帖耳呢，神权至上也就自然形成了，教主的神威也就树立起来了。
五、国度操练说
“国度”是全能神邪教虚拟的一个理想家园，他们称之为“神家”。全能神邪教对信徒控制得很严格，由“效力者”到“子民”需要经过试炼，合格后才能称之为“子民”，“子民”必须进入“国度”过“集体生活”，即离开自己的家庭，由“神家”集中管理，统一安排，接受“国度操练”。他在《认识神的最新作工跟上神的步伐》中强调：“所说的国度，是指在神性直接支配下的生活，所有的人都直接接受我的牧养，直接接受我的训练，使所有人的生活都是在地犹如在天，真正实现在三层天的生活。”这是全能神邪教诱惑信徒进入“国度操练”的谎言，一旦进入就是另一回事了，不是过上“三层天”的生活，而是献上一切。
他在《神向全宇的发声·第十三篇说话》中说：“国度的生活是子民与神自己的生活……为了结束大红龙，所有的人都应在我的国度之中为我献上你的全人。”由此可见，对信徒实施从肉体到精神的全面控制才是他们进行“国度操练”的初衷。为了打消信徒对家庭、对亲人的眷恋，他在《神向全宇的发声·第二十七篇说话》中说：“我是专门来破坏人的家庭的，当我来之时，人的家中便从此失去和平。我要将列国都砸得粉碎，更何况人的家庭呢？”。
同时，“国度操练”也是他们向信徒大肆搜刮钱财的由头，他们以“吃的、穿的，你的前途都在我的手中，我都会合适地安排”为借口，要求信徒为教会捐献，而且越多越好，他在《教会各项工作的安排和原则》中说：“奉献与捐献是每个信神之人的本分与职责……你是捐给神的，不是捐给教会或哪一个人的……这完全是由人的信心决定的……财主若能有约伯的信心，将自己所有的奉献给神，这是善行；有的人临终时也没有将自己所有的完全奉献给神，这是信神最大的失败。”有了人，有了钱，又有了信徒的忠心，他们就可以实施自己的计划了：“训练一批国度精兵……不是会讲大话的人，而是在何时都能活出神话的人，遭遇任何挫折都不屈不挠，无论何时都能凭神话活着。”（《实行真理才是有实际》）不难看出，全能神培养如此“国度精兵”，实质就是培养自己的骨干，为其扩展邪恶势力效力卖命。
六、国度福音说
“国度”是全能神为全方位的控制信徒而想象出来的自由乐园，是让信徒抛弃家庭、背离亲人、放弃事业而三五成群的聚集在一起任教主摆布的一种手段。所以他在《千年国度已来到》中将他们的国度描绘成人间美景：“千年国度在地上就是神的话来在了地上，新耶路撒冷从天而降就是神的话来在人中间与人同生活，伴随着人的一举一动、一个心思意念，这也是神要作成的事实，也是千年国度的美景。”
然而在“千年国度”的美景中，教主要给信徒们什么呢？他又编造出“福音”来迷惑信徒。他在《神向全宇的发声·第十九篇说话》中说道：“今天对我有真实的爱，这样的人有福了；对我顺服之人有福了，必在我国中存留；对我认识的人有福了，必在我国度之中掌权；对我追求的人有福了，必从撒但的捆绑之中逃脱出来，而享受在我之福；能够背叛自己的人有福了，必被我占有，承受我国中之丰富。”既然让信徒们背叛一切才能得到福，得到了福又能怎么样，于是教主又进一步欺骗信徒，他在《对被成全之人的应许》中说：“改变形像与神一同升到三层天，超脱肉体。能承受神的祝福，这才是被神成全的人……被神得着，能在地上承受神的祝福，承受神的产业。”最后结果是什么呢？他在《基督用真理来作审判的工作》中说：“最终，神将所有与神同心合意的人，神的子民、众子以及神所预定做祭司的人带入神的国度之中，这些都是神作工中得着的结晶。”
既然神给予信徒如此的好处，信徒们应该如何操练才能达到“千年国度”里呢？他在《“千年国度已来到”小议》中说：“神成全人就是洁净人，越洁净越被神成全。当你里面污秽的成份、悖逆的成份、抵挡的成份、属肉体的东西都去掉的时候，都被洁净的时候，你就是神所喜悦的（也就是圣者），当你达到被神成全成为圣者的时候，那时就是在千年国度里了。”
幸存于“千年国度”中的信徒们又该怎么样呢？是不是就可坐享其成呢？教主对他们也是有要求的，并以“好处”来诱惑他们。他在《神的作工与人的实行》中说：“凡在患难之中得胜的便成为国度之中的祭司团。成立祭司团是在全宇的福音工作都结束的时候，那时人所该做的就是在神的国度尽本分，在神的国度之中与神同生活。在祭司团中的有祭司长、有祭司，其余的是众子与子民，这都是根据患难之中对神的见证而划分的。”也就是说，在“千年国度”里的信徒们也是要有一定的层次可分，也要根据对神的贡献大小来论资排辈的。让你来“千年国度”是假，让你贡献出一切才是真。
在这样自由自在的国度里，就能成神吗？如果成不了神，又该怎么样呢？他在《神与人将一同进入安息之中》中说：“一个人能在最终活下来是因其达到了神的要求，一个人若不能在最终的安息中存活下来是因其本人悖逆了神，未能满足神的要求。”这样，教主就将那些无法成神，或是生老病死者以“未能满足神的要求”为借口，将自己的无能、无为、无神推卸的一干二净。由此可见，所谓的“国度福音”其实只是一张空头支票。
七、熬炼成神说
全能神邪教所说的“熬炼”是指通过反对“大红龙”（意指中国共产党）而实现的，他们自知自己的歪理邪说在社会上站不住脚，所以要千方百计地向信徒灌输仇视社会的邪说，让信徒接受考验，对抗政府。“熬炼是神成全人的最好方式，只有借着熬炼、借着痛苦的试炼，才能使人心里对神发出真实的爱……试炼更能成全人。”（《经历熬炼才有真实的爱》）所谓的“成全”就是进入他的“千年国度”，都成了神，这对信徒来讲是最大的诱惑，他们抛家舍业，捐献钱财，为的就是这个结果。
要想达到这样的目的，必须得到神的“称许”。怎么才能得到神的称许呢？他在《实行(七)》中说：“神现在作的工作给人带来一些熬炼，在熬炼中还能站立住的人才会得到神的称许……这是站住了神的见证。”也就是说，只有“站得住熬炼”，才能被“神”“称许”。而“熬炼”的实质就是让信徒为他“实际作工”效力，出去进行“传福音”散布反动言论，并称“熬炼是最后的一次工作，是在全部经营工作结束之前的最后一次熬炼，凡是跟随神的人都得接受这最终的检验，都得接受这最后一次的熬炼。”（《神的作工与人的实行》）同时，进一步蛊惑信徒：“无论神什么时候试炼，如何试炼你，你都能将自己的生命置于身外，能甘心为神舍掉一切，甘心为神忍受一切。”（《经历熬炼才有真实的爱》）由此可见，他利用“熬炼成神”诱惑信徒任其驱使，死心塌地地为其卖命。更卑鄙的是，他们煽动信徒进行“熬炼”，而他们却隐藏其后，幕后操纵，对信徒实施精神控制，使所有信徒成为他们的牺牲品。
八、社会败坏说
反社会、反政府是大多邪教的特征，在这方面全能神邪教有过之而无不及。在《实行(二)》中对中国的仇视达到了登峰造极的地步，他说：“中国这个国家属于最落后的，是大红龙盘卧之地，拜偶像、行邪术的最多，庙宇最多，也是污鬼群居之地。”对中国的仇视尚且如此，对中国人又怎么样呢？
他在《拯救摩押后代的意义》中说：“全宇之下，中国人是最落后的人类，出生低贱，人格低下，痴呆麻木，庸俗腐朽，撒但性情沾满全身，污秽淫乱，你们样样都有。”为什么中国人这样落后呢？全能神邪教主将罪责推到了中国共产党身上，于是他在《作工与进入(八)》中说：“神作的工作就是将赎回的、仍活在黑暗势力下的、从未觉醒的人从魔鬼集聚之地彻底拯救出来……将大红龙彻底摔死，摆脱这牛马一样的生活，不再做奴隶，不再被大红龙任意蹂躏、任意指使，你们不再属于这个败亡的民族，不再属于这个罪恶滔天的大红龙，不再受它奴役，魔鬼的“巢穴”必将被神摧毁，你们站在神的一边，是属神的人，不属于这个奴隶王国。”全能神邪教组织的反党、反社会、反人类狰狞面目暴漏无余。
他在《神话奥秘的揭示·第十篇说话》中进一步说：“道成的肉身所在之处正是仇敌灭亡之处，中国首先第一个被摧毁，被神的手灭没，神对它丝毫不留一点情面。”这样还不能消除对中国共产党的仇恨，又在《神向全宇的发声·第十篇说话》中号召信徒向共产党进攻，“一首国度礼歌在大红龙所在国家之中正式响起，足见我已摧毁了大红龙的国……我却亲临大红龙盘卧之地与之‘较量’，当所有的人都在肉身中认识我，能在肉身中看见我的作为时，大红龙的巢穴也就随之而归于乌有、化为灰烬了”。不难看出，邪教主的目的不是让信徒们成“神”，而是让信徒们一道反对中国，反对中国共产党，这就是全能神的目的所在，也是邪教的本质所在。
九、人类毁灭说
反对人类，宣扬“世纪末日”，也是邪教特征之一。全能神邪教在《真正的“人”指什么》中称：“人类，就是我的仇敌；人类，就是抵挡我、悖逆我的恶者；人类，就是被我咒诅的那恶者的后裔；人类，就是那背叛我的天使长的后代；人类，就是那早已叫我厌弃的与我针锋相对的恶魔的遗产。”为什么要消灭人类呢？他在《神与人将一同进入安息之中》中解释：“那些不愿意撇弃世界、舍不掉父母、舍不掉自己的肉体享受的人都是悖逆神的人，都是被毁灭的对象。凡不信道成肉身的神的人都属于魔鬼，更是将来灭亡的对象。”他消灭人类到底有多大的能力呢？他在《征服工作的内幕(一)》中说：“没有一人、一物能逃脱这刑罚、审判之苦的，也没有一人、一物不是各从其类的，人都分门别类，因为万物的结局都近了，整个天地都到了结束的时候了，人怎么能逃脱人生存的结束之日呢？”由此可见全能神邪教消灭人类的决心之大，歹毒之极。
世界末日，是邪教主恐吓信徒、诱骗信徒、控制信徒的一种手段。全能神邪教主不仅说世界要毁灭，而且还描绘出末日的情景，“水要咆哮，山要倒塌，大河要崩塌”，“导致地上之家都破裂，不再有母子重逢之时，不再有父女相聚之刻，所有在地的旧态都被我打破”。（《神向全宇的发声·第二十八篇说话的揭示》）他把世界末日说的不仅悲惨可怕，而且近在眼前。
为什么会有“世界末日”呢，全能神邪教主在《当为你的归宿预备足够的善行》中大言不惭地吹嘘：“因为我将人类的末日带给人间，从此，我将我所有的性情都公布于人类……这是我的计划，是我创造人类以来仅有的一次‘表白’。”他不但认为世界末日不是人类灾难，人间悲剧，反而认为是理所当然，甚至称“我将人类的末日带给人间”，并引以自豪地称之为“仅有的一次表白”，其反动、邪恶、歹毒，给人类带来灾难的邪教面目昭然于天下。
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