据“美国广播新闻网”（abcnews.com.co）2016年3月11日报道，美最高法院8名法官3月11日一致裁定，赞成取消科学教在美国的免税资格。根据该裁定，从2016年4月6日起，科学教在美国将不再享受免税资格。
美国国税局刑事调查科对科学教内部活动进行了长达两年的调查，调查结束后提起本项诉讼。刑事调查科经过审计，发现科学教是一个“以赚钱为唯一目的的犯罪组织”。8名法官支持国税局及其调查结果，认为科学教既不是常规宗教，也不符合非营利性慈善组织的标准，因此不能免税。
刑事调查科特别探员汤姆·唐尼在该案调查过程中密切配合国税局首席法律顾问的工作。汤姆·唐尼说：“如果私立学校也收取与科学教所设课程差不多的学费，那么学生将会得到国内顶级教师所带来的最高水平的教育”。但实际上，根本没有象科学教这样收费如此之高的学校存在，国内最好的学校也只是收取科学教向信徒索要高昂学费的一小部分”。
科学教发言人保罗·霍纳称该裁决是“对宗教信仰的歧视”。保罗·霍纳说：“在一个像我们这样自由的国家，一千多万科学教信徒的信仰就这样被践踏，我深感震惊。科学教正在努力让这个世界变得更美好，我们建造更多的建筑、船舶等等真正美妙的东西。但现在，因为少数宗教偏执狂，大多数项目将不得不被搁置”。
多年以来，科学教拥有千万信徒的说法一直饱受争议。2011年，前编辑、长期反对科学教的托尼·奥尔特加在网站“乡村之声”指出：“根据最新调查，在3亿多人口的美国，被确认为科学教信徒的总数是25000人。”
科学教宣称，7千5百万年前，一个名为兹努（Xenu）的银河系邪恶霸主，统治着银河系。为了解决人口过剩，他决定用类似DC-8型的宇宙飞船将13万5千亿人运往地球（当时称为“提基雅克”），将他们放入夏威夷火山，并引爆氢弹将他们汽化。
这些外星人的灵魂，也被称为“希坦”（thetan），在人类出现时进入他们的身体，而科学教创始人L·罗恩·贺伯特称这就是人类所有的恐惧、困惑和难题的根源。对人类来说，要想消除这种状态，必须要通过治疗将“希坦”从体内清除，科学教称之为“听析”（auditing）。
科学教信徒必须历时多年、经过八个阶段的“听析”才能将体内“希坦”清除干净，而每个阶段都将花费数千美元。法院正是对这些费用提出异议，裁定他们的收费远远超过教育机构的平均收费标准。
慈善组织“Sock It Forward”发言人莎拉·布拉德利告诉“美国广播新闻网”，因为科学教的隔断政策，她失去了家人。
莎拉·布拉德利说：“我出生在科学教，17时开始质疑他们的一些教义。我所有的家人都告诉我不要乱说话，但为时已晚，我被教会开除。科学教的高层管理人员告诉我，我不准与家人相见，也不准与他们交谈。这让我非常伤心，我甚至不能向他们告别。他们告诉我的家人，如果再与我有任何联系，他们也将被开除。我的家人选择了科学教抛弃了我。”
莎拉·布拉德利眼含泪水：“我只是希望我的家人能以我为傲，我现在所做的一切都是为了帮助无家可归的人。而我现在最希望的就是将来有一天能见到他们，我非常爱他们，也非常想念他们”。
唐尼告诉记者，科学教每年要花费数千万美元做一些其他任何非营利性宗教组织都不干的事情。
他说：“这笔钱用来骚扰前信徒、强制堕胎、确保国际基地的人无法逃脱、虐待儿童，强迫信徒与非科学教的家人和朋友断绝联系，向反对他们的人无休止地提起诉讼等。多年前，‘邪教警示网’是一个提供邪教相关信息的组织，却被科学教不断起诉，打了数年官司，最终被逼破产，现在成了科学教旗下的企业。多年以来科学教通过此法也将许多政府官员和政治家控制在手中。”
多年以来，科学教经常打着免税资格的旗号来证明自己是美国公认的宗教组织。而且毫无疑问的是，免税资格让科学教的产业得到了巨大的实惠。虽然信徒不是很多，但却拥有数十亿美元的资产，科学教被称为“世界上最著名的小型企业”。凭借免税资格，科学教每年仅房产税就可以省2千万美元。
“大赦国际”的罗伯托·西格蒙德告诉记者，撤销科学教在美国的免税资格是一场巨大的胜利。
“从多年来科学教造成的所有死亡事件到骗人的戒毒所，对于任何一个相信人权的人来说，这是一个伟大的日子。”
科学教于1957年首次被认定为免税宗教组织，1967年在国税局的审计过程中曾被取消免税资格。为了重新获得免税资格，科学教制定代号为“白雪公主行动”的行动，多次派人潜入国税局，偷偷复印了大量文件，并在国税局会议室安装电子窃听设备。参与此次行动的11名科学教高层人员，包括L·罗恩·贺伯特的妻子玛丽·苏·哈伯德被判刑。由于侦查员未能查证L·罗恩·贺伯特与本案有直接联系，他被列为未被起诉的同谋。
美国不是第一个取消科学教免税资格的国家。2015年10月，荷兰法院撤销科学教“社会公益机构”称号及其所享有的免税资格。
记者珍妮·皮特斯在“荷兰时报”网报道称，法院裁定，科学教兜售课程和疗程的目的是营利，因此不予列入税务机关慈善机构名单。
从2016年4月6日起，科学教在美国将不再享受免税资格。科学教有30天的上诉期，目前尚不清楚他们是否会上诉。